Les diarrhées néonatales du porcelet sont une préoccupation quotidienne pour les éleveurs, vétérinaires et techniciens. La seule détection d’une bactérie ou d’un virus (par culture, test génomique ou test rapide) n’est pas suffisante pour conclure quant à son rôle pathogène dans la maladie, une observation des lésions au niveau microscopique est indispensable pour conclure. Notre étude est une synthèse des germes détectés et des lésions observées chez 106 porcelets entre 2020 et 2022 afin de lier ces étapes diagnostiques indissociables. Dans plus de la moitié des cas (54 porcelets), plusieurs pathogènes présumés ont été détectés simultanément. Clostridium perfringens type A était le germe le plus souvent détecté (61,3 % des cas), suivi par Enterococcus hirae (43,4 %), le rotavirus de type A (38,7 %), le rotavirus de type C (3,8 %) et enfin Escherichia coli entérotoxinogène (3,8 %). Seuls Enterococcus hirae et les rotavirus étaient significativement associés à des lésions de l’intestin grêle.